안녕하세요.
검색창 같은 경우 css 에서 레이어로 잡혀있는것이라서 css 를 수정해주셔야하며. 왼쪽 columnLeft 안에 #isSearch 가 상속되어있어야 합니다. 그러기 위해서는 마크업할때 <form action="{getUrl()}" method="post" id="isSearch"> 부분이 columnLeft 안으로 들어와야겠죠? 트리메뉴 밑이라고 하셨으니, 그밑에 검색창 소스를 두면 되겠네요.

<div id="columnLeft"> 밑에 트리메뉴 소스 아래에 <form action="{getUrl()}" method="post" id="isSearch"> <-- 검색창에 관한 소스가 들어가면 됩니다. 그리고 css에서 레이어가 아닌 물론 position을 상황에 따라 줄수도 있습니다.
사이즈와 원하는 스타일로 수정해주시면됩니다.

그리고 위젯같은 경우는 당연히 레이어로 되어있지 않기 때문에 붕떠있지않고 같이 유동적으로 움직일수가 있는것입니다.